このＥＰＡ用の企業登録は、他の貿易登録とはまったく独立したもので、ＥＰＡ申請に特化した企業登録なのですが、費用はかからないため、無料で登録ができます。費用といえば、登録時の郵送料くらいなものです。

企業登録すると、ＥＰＡ専用の企業登録番号というものがもらえますので、取引先等に対してもこの番号があるとＥＰＡ申請の利便性が向上することがあります（入力の手間が省けたり、メーカーであれば輸出者に対して自社の特定原産地証明書の利用許可を与えたり）。

すぐにＥＰＡを使う予定がなくとも、企業登録しておくと万が一必要になった場合の手続きがスムーズに進みます。